四姑娘山的野生花卉资源丰富，不仅有相当一部分高山峡谷的区域性种类，更分布着很多我国西部高山和高原地区特有的成分。在这当中，既有被全世界赞誉为"中国高山、高原三大名花"的杜鹃花、报春花和龙胆花，又有以喜马拉雅山地区为现代分布中心的、种类繁多的马先蒿属植物，还有诸如绿绒蒿、圆穗蓼、珠芽蓼、黄芩、毛茛、金莲花、银莲花、梅花草、老鹳草、糙苏、风毛菊等五彩缤纷的典型亚高山和高山草甸成分，以及极其高贵的众多兰科植物。木本花卉方面，除杜鹃花外尚有凹叶瑞香、高丛珍珠梅、多种蔷薇、多种悬钩子、多种绣线菊和多种绣球等等。就各类野生花卉在四姑娘山景区核心地带的分布状况而言，几条山沟和不同海拔高度又各具特色。

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