一、气象、土壤特点
       1．气象
       a、气温
       根据附近气象站资料进行数学拟合的月平均气温如下：
       1——3月份为-2℃
       4——6月份为5℃
       7——9月份为13℃
       10——12月份为1.8℃
       b、降水
       据多年观测四姑娘山的雨量分配：
       1——3月份为38mm
       4——6月份为116.1mm
       7——9月份为546mm
       10——12月份为106.4mm
       降水主要集中在5至10月，降水量占年降水量的80%以上。
       年降水日数为150天左右；降水强度日雨量≥10mm日数，全年平均不超过20天；日雨量≥20mm日数全年平均仅1周左右；极少出现日雨量≥50mm的情况。
       四姑娘山年平均相对湿度约40%，相对湿度最低的11月至翌年1月份不低于20%，湿度较低，气候相对干燥；相对湿度最高6——8月份70%多，湿度适中，给人以舒适之感。
       c、雾量和日照
       四姑娘山平均总云量，接近6成，夏季可达7成以上，夏季雾日相对较多，而其他季节雾日较少。四姑娘山日照时数，全年2265小时左右，比四川盆地年日照1400小时，多900小时左右。日照百分率在53%左右，秋、冬、春三个季节相对夏季日照要多的多。
       d、风
       四姑娘山内，河谷幽深，一般情况下，风力适中，年平均风速仅1—3米/秒左右；春季风稍大约4米/秒以上；夏半年微风偏北，冬半年轻风偏南，夏日风和日丽，冬无烈风伤人。
2．土壤
       四姑娘山土壤的分布因受地理因素的影响，表现为垂直分布和区域交叉分布的特点。
       a、褐色土类
       褐色土类是沟内的主要土类之一，分布在海拔2900～3400m范围内，约占区域面积的30%。成土母质为古生代砂岩、花岗岩登等岩石的残坡积物。植被为中国沙棘、四川红杉、云杉、皂柳和桦木等植物组成的群落。
       b、高山草甸土类
       分布在海拔4200～4600m高程范围内的平缓坡地山原地带，发育于残坡积物和黄土母质，流石滩镶嵌于高山草甸土中。
       c、亚高山草甸土
       只要分布在海拔3800～4400m米范围内。主要为灌木生长地带，阴坡森林分布到海拔4200m。
       d、棕壤土
       主要分布在海拔3200～3800m之间，是保护区生物多样性最为集中的区域之一。
二、水文特点
       四姑娘山属长江水系大渡河上游区域。四姑娘山河由北向南汇入小金川，小金川与大金川在丹巴县汇合后称大渡河，流经甘孜、乐山，最后在宜宾汇入长江。四姑娘山河发源于邛崃山山脉四姑娘山峰，流域面积487.56km2，水系密度0.65km/km2，最大宽深比可达23:1，平均为5.2:1。主要支沟有双桥沟（大牛场沟、测量沟、大沟、木尔寨沟、流砂坡沟、白海沟）、长坪沟（虫虫脚沟、驴耳葱沟、两河沟、池温沟、池布沟、长沟）、海子沟（鹿放沟、半截沟、撵鱼沟、小沟双海子沟）、向阳沟、石梯沟、双碉沟、挑水沟、巴郎山沟、长河坝等，平均比降为42‰。区内湖泊众多，有冰斗湖26个，最大为羊满台海子，面积达2053800m2，而最小的仅数平方米；堰塞湖8个，面积最大为斯姑娜措，面积约2510120m2；沼泽湖7个，其中面积最大为花海子，面积约1902090m2。四姑娘山湖泊在分布具有如下特点：冰斗湖主要分布在海拔4600m以上的高山寒漠区；堰塞湖主要分布在海拔3700米以下的地区；而沼泽湖主要在3500m～4000m的地区。区内现代冰川发育良好，主要分布在海拔4600m以上的阴坡地区和海拔5700m以上的岩石区域，其中主要有双桥沟的布达拉峰冰川、阿妣山冰川、红杉林冰川、玉兔峰冰川等；长坪沟的三峰冰川、四峰冰川、夏格洛冰川、羊杠子冰川、长沟冰川、羊满台冰川、骆驼峰冰川、池布冰川等；海子沟的二峰冰川、三峰冰川、小沟冰川等；面积和蓄水量最大的是四峰冰川，面积约12km2,蓄水量约7200万吨。