本区鱼类共7种，分隶于2目3科5属，其中最为常见的是大渡裸裂尻鱼，除长坪沟外，在较多的调查点发现，其次为斯氏高原鳅，其余5种均在沃日大营盘河以下河段采到标本，在各支流很难见到。

       长坪沟过去曾采到鱼类标本，但这次3个调查点均未采到标本，其原因有待调查研究。海子沟有较多的大渡裸裂尻鱼，多在花海子及以下河段生活，花海子是其重要的产卵场，在双桥沟的撵鱼坝也是重要的产卵场，这是大渡裸裂尻鱼产卵场的重要发现。其他鱼类主要分布在大营盘以下河段，很少上溯到其他支流。有关鱼类在本区内的分布情况见附图:四姑娘山地区鱼类分布图。

       在这7种鱼类中，除黄石爬鮡和壮体鮡外，其余5种均属青藏高原鱼类区系，细尾高原鳅、长须裂腹鱼、大渡裸裂尻鱼、黄石爬鮡和壮体鮡等5种为长江上游特有种。其中，长须裂腹鱼和大渡裸裂尻鱼为大渡河的特有种。短尾高原鳅、斯氏高原鳅和细尾高原主要分布于青藏高原地区，斯氏高原鳅可分布于约5000m以上高原河流，然而在西牛海子(4500m)等高山湖泊都未见有分布，有待进一步调查。

       不同种类的鱼类其主要栖息区有一定的范围，通常鱼类的栖息区是随栖息环境不同而发生变化的，栖息环境的不同，分布的鱼类亦随之而异，尤其与海拔高度有关。本区鱼类分布最广，栖息高度最高的种类为大渡裸裂尻鱼，最高可上溯到海拔4000m的河段。其次是斯氏高原鳅可见于3300m河段，其余5种较常见于3000m以下河段。

       本区鱼类与卧龙地区鱼类相比较有明显的差异，卧龙地区由于海拔较低，分布的种类相对比较多，约11种，其区系特点为盆周山区河流鱼类特点，而四姑娘山地区地势高亢，气候寒冷，鱼类区系特点表现为青藏高原鱼类类群特征，这是本区鱼类组成的显著特点之一。